La actual estructura orgánica del Instituto Peruano del Deporte, fue aprobada de acuerdo con las disposiciones legales vigentes y en amparo de la Ley de Desarrollo y Promoción del Deporte, donde se dispone que el Instituto Peruano del Deporte es competente para aprobar su organización interna.

Es necesario indicar que la actual estructura orgánica es el resultado de haber efectuado un análisis para lograr las condiciones para un mejor funcionamiento del IPD.